Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms