Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF135P52742 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF135P52742 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms