Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A2P52657 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms