Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LUMP51884 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LUMP51884 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LUMP51884 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LUMP51884 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LUMP51884 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms