Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms