Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTPAP49638 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TTPAP49638 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTPAP49638 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTPAP49638 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTPAP49638 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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