Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX5P48382 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX5P48382 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX5P48382 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX5P48382 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX5P48382 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms