Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSN1S1P47710 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms