Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTRNP46939 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTRNP46939 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTRNP46939 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTRNP46939 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTRNP46939 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTRNP46939 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTRNP46939 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTRNP46939 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms