Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MLH1P40692 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MLH1P40692 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MLH1P40692 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MLH1P40692 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MLH1P40692 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MLH1P40692 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms