Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms