Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1E1P36543 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms