Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GJC1P36383 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GJC1P36383 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GJC1P36383 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GJC1P36383 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms