Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPB2P35606 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPB2P35606 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPB2P35606 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms