Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPS1P31327 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPS1P31327 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CPS1P31327 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPS1P31327 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPS1P31327 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPS1P31327 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPS1P31327 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPS1P31327 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPS1P31327 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPS1P31327 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPS1P31327 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPS1P31327 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPS1P31327 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPS1P31327 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPS1P31327 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPS1P31327 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPS1P31327 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPS1P31327 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPS1P31327 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPS1P31327 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CPS1P31327 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPS1P31327 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPS1P31327 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms