Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA11P31270 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA11P31270 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA11P31270 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA11P31270 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA11P31270 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA11P31270 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms