Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND2P30279 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND2P30279 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND2P30279 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND2P30279 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND2P30279 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND2P30279 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND2P30279 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND2P30279 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCND2P30279 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCND2P30279 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCND2P30279 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND2P30279 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND2P30279 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND2P30279 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND2P30279 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms