Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHC1P29353 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHC1P29353 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHC1P29353 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms