Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E2P29084 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms