Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms