Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
JAK1P23458 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JAK1P23458 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
JAK1P23458 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
JAK1P23458 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JAK1P23458 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
JAK1P23458 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JAK1P23458 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JAK1P23458 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms