Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
S100A1P23297 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S100A1P23297 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
S100A1P23297 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms