Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms