Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD247P20963 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD247P20963 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD247P20963 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD247P20963 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD247P20963 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms