Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB3BP20337 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms