Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL17P18621 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL17P18621 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL17P18621 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL17P18621 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL17P18621 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL17P18621 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL17P18621 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL17P18621 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL17P18621 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL17P18621 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL17P18621 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL17P18621 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL17P18621 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL17P18621 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL17P18621 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL17P18621 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL17P18621 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL17P18621 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL17P18621 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL17P18621 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL17P18621 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms