Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms