Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRF1P14222 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRF1P14222 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRF1P14222 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRF1P14222 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms