Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI3P10071 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI3P10071 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI3P10071 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI3P10071 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI3P10071 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI3P10071 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI3P10071 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI3P10071 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI3P10071 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI3P10071 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GLI3P10071 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GLI3P10071 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GLI3P10071 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI3P10071 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI3P10071 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI3P10071 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms