Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC159P0C7I6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC159P0C7I6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms