Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK1P06493 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK1P06493 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK1P06493 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms