Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VTNP04004 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTNP04004 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTNP04004 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VTNP04004 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VTNP04004 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VTNP04004 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTNP04004 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTNP04004 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTNP04004 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTNP04004 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTNP04004 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTNP04004 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms