Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV12-3P01733 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV12-3P01733 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms