Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTAP01040 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTAP01040 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTAP01040 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSTAP01040 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSTAP01040 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTAP01040 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTAP01040 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTAP01040 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTAP01040 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTAP01040 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTAP01040 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTAP01040 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms