Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINC1P01008 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINC1P01008 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms