Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIX6O95475 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIX6O95475 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIX6O95475 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX6O95475 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX6O95475 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX6O95475 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX6O95475 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms