Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOL3O95236 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOL3O95236 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms