Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIOO75962 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIOO75962 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIOO75962 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIOO75962 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIOO75962 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIOO75962 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIOO75962 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIOO75962 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIOO75962 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIOO75962 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms