Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIA4O75335 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms