Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms