Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP9BO43861 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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