Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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