Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNJ2O15056 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYNJ2O15056 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SYNJ2O15056 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms