Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms