Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HHLA1C9JL84 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HHLA1C9JL84 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms