Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B4DXG7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B4DXG7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B4DXG7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms