Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00473A8K010 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms