Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms