Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf51A6NDU8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms