Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSDA5PKW4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms